Setiap pesantren dan institusi pendidikan memiliki hidden curriculum alias kurikulum tersembunyi, yang tidak diajarkan di kelas. Kurikulum yang sering disebut dengan kurikulum tersembunyi karena kurikulum tersebut tidak diajarkan di dalam kelas akan tetapi kurikulum tersebut dilaksanakan dan dipraktekkan dalam kehidupan di luar kelas. Pendidikan di Pondok Modern ar-Risalah juga mengenal kurikulum tersembunyi ini.
Di antara kurikulum tersembunyi yang dipraktekkan dalam kehidupan santri adalah kegiatan esktrakurikuler, kegiatan jaga malam, kegiatan pembersihan umum dan kegiatan mengikuti kegiatan di Pondok Modern ar-Risalah selama 24 jam. Dari dinamika kehidupan Pondok Modern ar-Risalah yang padat ini, diharapkan akan melahirkan sosok-sosok santri yang mempunyai militansi dan daya juang yang prima.